博士的控制室是一个大约有90平米的地方。这里摆满了各种小零件小工具，桌子上依旧可以通过能量追踪装置看到他遗留在上面的能量痕迹。“不要杀我，不要杀我！”
博士虽然很疯狂，不过在面对自己面前的敌人时他相当直接。
“你叫什么名字！”
“博文。”
“博文？这个名字还挺陪你的，快把解药叫出来！”汉夫在博文博士的示意下从他的口袋中掏出了一瓶淡蓝色的液体，随后博文博士结结巴巴的说话道“你……不会……杀了我吧！”
“当然不会，我们留着你还有用，让你最联邦做出些许救赎。”
碰！厚重的金属闸门在撞击声中被毁坏，山姆和薇薇安几人带着玛丽来到了房间内。
“快给她喝下去。”
此刻的玛丽虽然有安的异能在持续为她修复创伤，不过修复的部位一停下来便会复发，所以为了让她赶快恢复健康淡蓝色的解药马上被服下。
随着解药的服用玛丽的身体肉眼可见的消退起来，那些被能量包裹着险些爆裂的血管也恢复了正常。
玛丽的伤治好了大家都没有想到会在这么短的时间内从敌人变成非敌人。“你为什么要这么对我？”玛丽睁开眼睛后第一眼便是紧盯着博文博士不放，她非常想知道最被疼爱的她为什么会变成牺牲品。
“没……没有原因，只因为……”还没等博文博士说完玛丽便接话道“只因为我是你的一颗棋子吗？你从来没有真的对我好过吧！”一语道出心酸的滋味让这个本来坚强的女克隆人哭了起来。
看到玛丽哭泣博文博士开始纳闷了，因为他没有为她激活情感区域，所以她无法理解为什么会有情感生活，不过这已经不再重要。
“博士，现在如果你想要安全的话就和我们同行，一起前往联邦总部吧。我知道你就是那个让智慧智脑宕机的人。”虽然博文博士所做的事让旧联邦的人千刀万剐也不解恨，不过为了让联邦早日恢复秩序与和平他必须得到保护。
听到联邦总部几个自后博文博士像是受了刺激一样开始瑟瑟发抖，他的肢体动作加上“我不去，我不回去那里。”的重复话语让人觉得他好像真的疯了。
虽然他不想去不过这也由不得他，毕竟联邦的大多数人还在等待补给的到来。
按照原路返回的时候一切变得畅快许多，因为没有了障碍；那些机器人已经被装甲守卫打成了零件，那些生化人则因为博文博士的控制消失而瘫痪。
按照博文博士说的，大家把休眠中的人类实验者救了出来，他们与汉夫等人一同乘坐飞船来到了安全的地方。
“你不一同与我们战斗吗？”汉夫望着这个坚强的女克隆人缓缓的道。
“不了，我要开始我真正的人类生活，当然也请你们不要想我。”随着玛丽的话语过后她将从博文博士的实验室中拿出的记忆替换装置戴在头上快步走下飞船的旋梯。
玛丽决定开始新的生活。她想要做一名志愿者与那些失去家园的人类一起生活，因为她觉得那里才有家的味道以及适合自己重新生活的开始。
飞船在将人类实验者交付到猛虎佣兵所在的战舰后便载着博文博士和佣兵们飞翔至了联邦总部的入口处。
“未识别的飞行器，你没有获得联邦智脑的通行许可。”机械的合成音凭空出现，它回荡在飞船内好像是飞船本身发出的。
“验证联邦权限，博文博士。”汉夫快速说出了博文博士的名字后并将博士的联邦界面设定至了验证状态。
“正在获取生物磁识别……成功，允许登陆。”
联邦总部的门旋转着打开了。虽然外部位置一片漆黑，不过内部结构却相当明亮。
“一排排的装甲人和克隆人看上去真壮观。”薇薇安以及安像是在看风景般看着眼前出现的战斗力。
“恩，如果我们不是有疯子博士的授权的话也许就不会这么悠闲了。”山姆开玩笑道，不过山姆的玩笑让飞船刚接近内核的博士开始大声狂笑。
他一边笑一遍大喊“你们虽然来到了联邦总部不过这又能意味着什么？我可以让你们进入联邦总部但是智慧的智脑大厅你们是无法进入的，因为我也无法进入。这里需要的是联邦星系权限100万，也就是说你们没有100万联邦权限根本无法打开这里。”
大笑特笑的声音让薇薇安听着很不耐烦，由于她之前便与博文博士有了矛盾所以此刻的她非常希望博士能够再次失望。
“我亲爱的博文博士，也许你失算了，谁说这里没有100万联邦权限的佣兵存在？”语调柔和的薇薇安走到汉夫身边将其拦住，然后缓缓的道“你看看汉夫·雷顿先生能不能胜任这项任务啊？”
大家走出了飞船后踏在了金属质地的地板上，面对眼前的识别装置汉夫当然是自告奋勇的走了上去。
“联邦权限验证成功，允许进入。”只听智脑的回音再次出现后一道左右开合的闸门便打开了，露出了与联邦星系一模一样的智脑大厅。
虽然说是一样，不过仅限于摆设与装饰完全相同，就连每条文理的颜色也完全与联邦的智脑大厅相同。
“这里发生了什么！”虽然说是相同的地方多，不过还是有不同的地方，而不同的地方便是没有来得及修复的弹孔和破坏痕迹。
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